Δεν έχουν τέλος οι καταγγελίες για τα όσα συνέβαιναν στη ΜΚΟ «Κιβωτός του Κόσμου» και αφορούν σε τιμωρίες, ξυλοδαρμούς και κακοποίηση παιδιών.
Σύμφωνα με μαρτυρία που φέρνει στη δημοσιότητα η εφημερίδα «Ελευθερία της Καλαμάτας», στα τέλη Ιανουαρίου του 2022 από τη δομή της «Κιβωτού του Κόσμου» στην Καλαμάτα μεταφέρθηκαν στην Αθήνα τέσσερα παιδιά, επειδή ο πατέρας Αντώνιος έκρινε ότι έπρεπε να «συνετιστούν, καθώς είχαν μπλέξει με κακές παρέες» στην πρωτεύουσα της Μεσσηνίας.

Τα παιδιά, όμως, αυτά όταν ήρθαν στην Αθήνα έμειναν, σύμφωνα με τη μαρτυρία, κλειδωμένα για δύο μήνες προκειμένου να... συνετιστούν.

Ακολούθησε ένα ταξίδι μικρότερων παιδιών, επίσης από την Καλαμάτα, στη δομή του Κολωνού, με τη μαρτυρία να αναφέρει ότι ο πατέρας Αντώνιος έβαλε τα μεγαλύτερα παιδιά που κρατούσε κλειδωμένα να γονατίσουν μπροστά στα μικρότερα και να παρακαλέσουν για συγχώρεση επειδή φάνηκαν ανάξια.

Σύμφωνα με τη μαρτυρία, τα μεγαλύτερα παιδιά «είχαν σημάδια ξυλοδαρμού, ήταν βρώμικα και παραμελημένα».