Ο Γιάννης Μπαλάφας στον τελευταίο ανασχηµατισµό, του Νοεµβρίου του 2016, τοποθετήθηκε στη θέση του υφυπουργού Μεταναστευτικής Πολιτικής. Μέχρι τις 2 Ιουνίου 2017 δεν του είχαν ανατεθεί οι αρµοδιότητες που θα έπρεπε να έχει, κάτι που προκαλεί εύλογα ερωτήµατα. Το κυβερνητικό «αντικείµενό» του οριστικοποιήθηκε προ ηµερών, στις 9 Ιουνίου, οπότε µε σχετικό ΦΕΚ τού ανατέθηκαν αρµοδιότητες που σχετίζονται µε την τήρηση και την παρακολούθηση των µητρώων των ΜΚΟ, µε θέµατα της Γενικής ∆ιεύθυνσης Ιθαγένειας και Μεταναστευτικής Πολιτικής, αλλά και µε τον σχεδιασµό και την ανάπτυξη τεχνολογιών για την υποστήριξη των αναγκών του υπουργείου.

Το ενδιαφέρον είναι ότι, µπορεί να µην του είχαν ανατεθεί αρµοδιότητες, ωστόσο αυτό το γεγονός δεν τον εµπόδισε από το να επανδρώσει το υπουργικό του γραφείο µε 12 άτοµα, τρεις µετακλητούς υπαλλήλους, έναν ειδικό σύµβουλο, έναν ειδικό συνεργάτη και επτά αποσπασµένους από άλλες υπηρεσίες του ∆ηµοσίου. Ετσι, σύµφωνα µε τη «∆ιαύγεια», οι µόνες αποφάσεις του µέχρι και τις 13 Ιουνίου αφορούσαν τις υπερωρίες των εργαζοµένων στο γραφείο του τους µήνες Νοέµβριο-Απρίλιο.