Μετά ταν Θανάση Θεοχαρόπουλο, και ο Γιώργος Τσίπρας ετέθη εκτός των επιστημονικών συνεργατών στην Κ.Ο. του ΣΥΡΙΖΑ. Την εξέλιξη αυτή έκανε γνωστή ο ίδιος με το εξής μήνυμα:

«Δέκα λεπτά μετά από ραδιοφωνική συνέντευξη στην ΕΡΑ, στην οποία υποστήριξα την ανάγκη ανασύνθεσης του προοδευτικού χώρου και δημοκρατικής λειτουργίας των κομμάτων, ενημερώθηκα ''σχετικά με τη λύση σύμβασης εργασίας'' από τον ΣΥΡΙΖΑ. Πρόκειται μάλλον για σύμπτωση, σε συνέχεια άλλων συμπτώσεων. Προφανώς η ανασύνθεση του προοδευτικού χώρου θα προχωρήσει παρά τα όποια εμπόδια, γιατί είναι απαίτηση της συντριπτικής πλειοψηφίας. Επίσης, η κατάκτηση εδώ και δεκαετίες για δημοκρατία στα κόμματα, όπως και στην κοινωνία δεν θα υποκλιθεί σε επικίνδυνες αντιλήψεις που αναφέρονται μόνο σε δικαιώματα και καθόλου στην πολύ βαθύτερη και ευρύτερη ανάγκη δημοκρατίας, διαφάνειας και λογοδοσίας. Σε ό,τι με αφορά, δεν ανήκω στο κλαμπ όσων δεν θα χρειαστεί να ξαναδουλέψουν στη ζωή τους, αλλά και σχεδόν ποτέ δεν συνδυαζόταν η πολιτική μου δραστηριότητα με επαγγελματική κομματική σχέση».

Πηγές Κουμουνδούρου για Γιώργο Τσίπρα: Είχε συμφωνήσει να πληρώνεται μέχρι το τέλος των ευρωεκλογών

Πηγές της Κουμουνδούρου έλεγαν ότι ο Γιώργος Τσίπρας είχε συμφωνήσει να πληρώνεται μέχρι το τέλος των ευρωεκλογών, προκειμένου στη συνέχεια να ξεκινήσει να πληρώνεται ο νέος διευθυντής της Κ.Ο., Θάνος Μωραΐτης. Ο Γ. Τσίπρας διαψεύδει αυτή τη διάσταση. Το ερώτημα προφανώς είναι ποιοι επιλέγουν τη συγκεκριμένη στιγμή να κάνουν «εκκαθαρίσεις» και αν υπάρχει λίστα προγραφών, όπως ισχυρίζονται πολλά στελέχη από αυτά που διαφωνούν με τον Στέφανο Κασσελάκη.

Eπίσης, όπως αναφέρει η Κουμουνδούρου: «Ο Γιωργος Τσίπρας είχε έμμισθη σχέση με τον ΣΥΡΙΖΑ ΠΣ ως διευθυντής της ΚΟ παρόλο που είχε πάψει να βρίσκεται στη θέση αυτή εδώ και τρεις μήνες. Ο ίδιος είχε ζητήσει να συνεχίσει να πληρώνεται για έναν επιπλέον μήνα, μετά την αντικατάστασή του και την υποβολή υποψηφιότητας για στην ευρωβουλή, ώστε να διατηρήσει την ασφαλιστική κάλυψη κι έμεινε τελικά έμμισθος για πολύ μεγαλύτερο διάστημα από ότι είχε ζητήσει. Ολα όσα ο ίδιος υποστήριξε ότι δήθεν αποτέλεσαν την αιτία της διακοπής της σύμβασης του, είναι τουλάχιστον προσχηματικά καθώς δεν ήταν "εκτός γραμμής" όσων ο Πρόεδρος του κόμματος, Στέφανος Κασσελάκης, είχε ανακοινώσει στην συνεδρίαση της ΚΟ, την προηγούμενη εβδομάδα».